Diskusi hubungan ekosistem (ekologi) dengan keanekaragaman hayati

Teori biogeografi pulau mengatakan bahwa jumlah spesies yang terdapat pada suatu pulau akan ditentukan oleh luas pulau. Nilai perimbangan antara rerata laju kepunahan dengan laju migrasi akan menentukan jumlah spesies yang bertahan dalam suatu pulau. Jumlah spesies yang terdapat di pulau-pulau yang berlokasi dekat dengan benua jauh lebih banyak daripada jumlah spesies yang berada di pulau-pulau jauh dari benua. Artinya derajat keanekaragaman hayati dan laju kepunahan lokal ditentukan oleh luas pulau sedangkan kecepatan migrasi ditentukan oleh jarak pulau ke sumber.

Keanekaragaman hayati di Indonesia sangat dipengaruhi oleh wilayah biogeografi negara, yang merupakan pertemuan antara kawasan Oriental dan kawasan Australia. Kedua kawasan tersebut dipisahkan oleh garis Wallace sehingga terbentuk wilayah di bagian barat dan timur. Karakteristik satwa dan flora di wilayah timur Wallace miskin (sedikit) kekayaan jenisnya tetapi tingkat endemisme-nya tinggi, sebaliknya satwa dan flora di wilayah barat Wallace memiliki kekayaan dan keragaman jenis yang tinggi namun rendah untuk tingkat endemisme-nya.